La intención original desde los inicios era conseguir un camiseta futbol baratas uniforme azulgrana. Para la temporada 2013/14 en Segunda División B la única meta del club era conseguir la permanencia en la categoría. En estos más de tres años y medio el club fabril ha tenido que hacer frente a la deuda de 1,2 millones de euros con la Seguridad Social, a un concurso de acreedores, a la pandemia del covid-19, entre otros escollos, hasta que se llevó a cabo la inscripción de la nueva Sociedad anónima deportiva, con un capital de 2,4 millones de euros, en el Registro Mercantil de Bizkaia, tras inscribirse previamente en el CSD, los dos últimos trámites burocráticos que restaban para llegar a la meta deseada. En la temporada 2012/13, el club tiene como única meta el ascenso a la Segunda División B. Se confecciona una plantilla competitiva con jugadores profesionales. A partir del mercado invernal, el Burgos encadenó una serie de resultados positivos que le hicieron soñar incluso con la posibilidad de alcanzar los puestos de play-off de ascenso a Segunda División. En los play offs de ascenso, quedó emparejado con el filial del Deportivo de la Coruña, el Depor «B», perdiendo la eliminatoria en el partido de vuelta en el estadio de Riazor en la tanda de penaltis; pero al haber acabado la liga como líder de grupo, al Burgos CF todavía se le concede otra oportunidad de ascenso en caso de ganar otras dos eliminatorias más.
El equipo beneficiado por esta decisión fue el Levante UD que, tras haber finalizado 19.º en puestos de descenso, mantuvo la categoría. Ampliación de la categoría a cien equipos divididos en cinco grupos. El Burgos CF finalizó el año 2020 en la decimocuarta posición del Grupo 2, con seis partidos ganados, cinco empatados y nueve perdidos. Cinco blancas usadas como local por el Valencia CF, cinco piezas alternativas usadas como visitante y cinco pieles que lucieron algunos de los mejores porteros que han ocupado las porterías del viejo Mestalla. El estadio fue inaugurado en un partido frente al Nürnberger Fussball Verein, una semana antes de la inauguración del Estadio de Mestalla. Después de aquellos gloriosos tiempos el Burjassot CF ha militado la mayor parte de su historia en categorías regionales, si bien en la primera década del 2000 militó en Tercera División habiendo disputado la fase de ascenso a Segunda división B la temporada 2001-2002 y habiéndose quedado a las puertas la 2005-2006 y 2006-2007. En marzo de 2014 muchos jugadores se ven en una situación económica incómoda y deciden abandonar el club en medio de la temporada, al igual que el míster. En 1890 no pudo ser reelegido y se unió a la Football Alliance, que ganaron, y por lo tanto, volvieron a ser parte de la Football League.
Tanto, que aún hoy algunos consideran aquel partido como uno de los mejores que se ha visto en España. Luego existen webs Chinas con estas mismas réplicas con un precio muy similar, pero que tienes que esperar hasta meses para poder recibirlas… El club blanco llegó a ofrecer hasta 14 millones de euros al Valencia. Eleva tu amor por el fútbol al siguiente nivel con la Camiseta de Primera Equipación Valencia CF versión fan. A su vez, el Burgos Club de Fútbol y el Club Deportivo Nuestra Señora de Belén firmaron un acuerdo para crear el primer equipo femenino, camisetas del valencia que a partir de la temporada 2020 militaría en la Segunda División del Fútbol Femenino. En diciembre de ese mismo año, su hijo Franco fue nombrado por la Junta General de Accionistas del Burgos CF como presidente de la institución. El domingo 18 de diciembre de 2016, se jugó el partido correspondiente a la jornada 19 de liga contra el CD Boiro, encuentro que concluyó con el resultado de 0-2 para el cuadro gallego y que supuso el último partido de Juan Carlos Barriocanal como presidente del Burgos Club de Fútbol.
Un grupo de empresarios encabezados por el empresario hotelero Juan Carlos Barriocanal negocia con Domingo Novoa su salida del club. La siguiente temporada 1982/83, ya en Segunda División B, el equipo queda 3.º del grupo I pero la situación económica es insostenible. Tras un buen inicio de liga, llegando a ser líder del grupo II de Segunda División B, el equipo comienza a perder posiciones. La temporada 2018-19 es de continuo sufrimiento para el equipo que coquetea todo el año con el descenso. Tras fallar una ocasión de gol cuando el cuadro merengue perdía 1-0, al adelantarse en una acción defensiva de Dimitri Foulquier para salvar a los naranjeros, ‘Vini’ cayó al césped y fue recriminado por el portero rival, que le tocó la espalda para que se levantara. El presidente le encomienda que haga una plantilla competitiva pero con poco presupuesto, ya que la política austera del presidente desde que tomó el mando del club, hace que para la confección de la plantilla destine un porcentaje muy pequeño del presupuesto anual total, siendo este uno de los más altos de toda la Segunda División B, con el fin a largo plazo de ir reduciendo la pequeña deuda que arrastra el club desde hace años.