Tal y como explicó hace escasas fechas la entidad rojilla, camisetas de fútbol baratas la camiseta especial de Osasuna para la final de la Copa del Rey estará a la venta para los aficionados pero por plazos de producción de Adidas tan solo se disponen de 1.000 unidades a la venta desde ya en la tienda física de El Sadar. Quique Sánchez Flores. Este a su vez también deja el club pocas semanas después por desavenencias con el presidente Ángel Torres y la venta de fichas de jugadores. En la temporada 2009-10 se proclama sexto en la Primera División tras sumar 58 puntos y con ella clasificarse para la Europa League (antigua UEFA) tras ganar al Club Atlético de Madrid 1 a 3 en el estadio Vicente Calderón y así consumar una magnífica temporada bajo las órdenes de Míchel. El máximo goleador del Getafe fue Roberto Soldado, que una temporada después fue fichado por el Valencia CF al hacer una muy buena campaña, al igual que Pedro León, el cual fue fichado por el Real Madrid Club de Fútbol. Al club retornan jugadores como Daniel Güiza, Pedro León o Alexis Ruano, destacando el canterano Abdelaziz Barrada y el portero cedido por el Valencia, Miguel Ángel Moyá.
Esto le hace al entrenador del Getafe C. F. merecedor del primer Trofeo Miguel Muñoz. El 27 de mayo de 2024, se anunció su fichaje como nuevo entrenador del Club Atlético Osasuna, también en Primera División, tras la marcha del hasta entonces entrenador del conjunto rojillo, camisetas de futbol baratas 2024 Jagoba Arrasate. Todos ellos siendo capitanes del equipo en la temporada anterior a su marcha. Esta información se confirma el día 25 de abril de 2011 por parte del presidente del club Ángel Torres Sánchez en rueda de prensa, y se comunica que entraría en vigor el 1 de julio de 2012. Pasado un año, por informaciones contradictorias por parte de la dirección del club y de Royal Emirates Group se desconocía cual había sido el acuerdo firmado entre ambos, y el futuro del mismo. El club disputa sus últimos partidos de la temporada sin presentar un entrenador titulado, siendo multado por ello varias veces. El 17 de mayo de 2016, Jos Luhukay fue anunciado como el nuevo entrenador en jefe. En la siguiente temporada finaliza el contrato de Míchel como entrenador y se ficha a Luis García Plaza por un periodo de tres años. El 10 de marzo de 2014 es destituido el entrenador Luis García Plaza por llevar una racha de doce jornadas seguidas sin obtener la victoria y estar a un punto sobre el descenso.
Esta temporada lleva al entonces entrenador azulón, Bernd Schuster, a fichar por el Real Madrid, sustituyéndole en el banquillo getafense Michael Laudrup. La tercera temporada consecutiva en la Segunda División de España supone la consolidación en la categoría, aunque no de manera muy holgada, pero que posibilita que la campaña siguiente se produzca un salto de nivel y que el equipo ocupe los puestos altos de la clasificación con posibilidades de ascenso hasta casi el final de la liga. A pesar de esta eliminación, en conjunto el Getafe realiza una gran campaña en esta primera Copa de la UEFA que disputa en toda su historia, eliminando a equipos como el Benfica, o el AEK Atenas FC, además de vencer clubes históricos como Tottenham Hotspur o RSC Anderlecht. Se enfrentará en su primer partido al Celta de Vigo, con el que empatará a un gol, y finalizará aquella campaña en cuarta posición. La temporada 2017-18 supuso un punto de retroceso para el equipo que pasó de luchar por Europa a la zona baja de la clasificación, los malos resultados provocaron el hundimiento del equipo que acabó en decimosexta posición con 43 puntos, lo que supuso la peor clasificación desde el bienio negro.
Hasta final de temporada le sustituye Pablo Franco Martín que era técnico del filial. La temporada 2006-07 vuelve a quedar noveno con 52 puntos, y sorprendentemente se planta por primera vez en la final de la Copa del Rey tras eliminar a Xerez C. D., Valencia C. F., C. A. Osasuna y F. C. Barcelona, contra el cual volteó una semifinal que se había complicado mucho en el partido de ida (5-2 en el Camp Nou donde Messi metió un gol considerado copia del gol de oro de Maradona), endosándole un 4 a 0 en el Coliseum. Por ello, Osasuna ha querido diseñar una nueva equipación con motivo del partido que les enfrentará al Real Madrid el próximo 6 de mayo. Su uso está destinado a los entrenamientos de los diversos equipos del club y a la disputa de partidos de los equipos de categorías inferiores. El 27 de mayo de 2012 se celebra una concentración por una plataforma de aficionados denominada «Getafe somos todos» en la puerta 0 del Coliseum en protesta por considerarse una «afición maltratada» por el club compareciendo aproximadamente quinientos aficionados del equipo. El 27 de junio de 2012 se hace público que una supuesta trama de estafadores encabezada por el empresario español Joan Batalla Juanola había sido detenido el 19 de junio por los Mozos de Escuadra.